精准医学研究首选——血液DIA蛋白定量分析产品
血液汇聚了体内生命过程中的重要分子，血浆定量蛋白质组科研论文发表的蛋白质鉴定水平主要在300-400种蛋白质
[1]，行业大牛的文章水平也在500-600种
[2]。华大科技推出的全新血液蛋白质组DIA定量分析蛋白鉴定数突破1500种，覆盖更多低丰度低分子量蛋白，涉及更多功能蛋白质种类，同时可对血液中蛋白质组进行定量分析，技术稳定性高达90%，是大队列血液样本蛋白质组研究的创新解决方案。
血液样本用于疾病研究
血液样本由于它的体内循环特性，汇聚了所有组织的生理学与病理学过程所产生和交换的分子物质，可作为生物标志物及分子作用机制研究发现的重要窗口。血液作为临床上无创或微创容易获取的检测样本，所以也是常用的研究对象。基于血浆或血清的蛋白质组学研究可应用于疾病蛋白标志物的发现，健康生理参考基线的建立，药物调控及副作用机制研究，以及结合转录组、代谢组等其他组学更加全面的多组学贯穿研究，用于疾病精准诊断治疗和大健康数据精准监测。
推荐研究思路——生物标志物寻找
1. 发现阶段
每组选取10个以上的血浆或血清样本，采用DIA定量的方法鉴定潜在biomarker。预计能鉴定到上千种蛋白质，找到百种差异蛋白。通过与疾病表型、其他组学差异基因或代谢物的通路关联分析，进一步筛选出更显著更相关的差异蛋白。
2. 后期验证手段
a) 扩大群体验证(Additional cohort）
选择相同组别新的样本群体，最好有跨中心（医院）的样本，进一步验证研究结果。常见方法：MRM、PRM、Western blot或ELISA等技术。
b) 时间纵向研究（Longitudinal cohorts ）
对同一人群进行不同时间点研究，不同用药时期的研究，分析疾病发生发展及治疗过程中的蛋白质的动态变化，进一步提高诊断和监测的精准性。
c) 动物模型验证
动物实验可以通过严格的实验设计，控制环境因素及宿主因素对结果的影响，有利于大量生理生化指标的检测。可以动物模型对发现阶段的biomarker进行验证。
d) 体外功能验证
通过深入的体外功能研究明确biomarker的作用机制。常见方法：基因敲除、CRISPR技术。
产品特点
1. 样本数量不受限制，不需要pooling样本，可以单个个体检测。
2. 技术重现性好，可达90%；定量稳定性高，CV低于25%；
单个个体研究的好处：1）避免混样，标志物被个体差异性而拉平；2）可以对数据进行后处理，例如依据数据结果进行重新分组或者剔除异常样本。
周期
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样本数 |
自然日 |
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≤25 |
44 |
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25-50 |
54 |
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＞50 |
每增加10个样本，增加6个自然日 |
送样建议
血浆或血清≥200µL
应用案例
1. 血清蛋白质组学鉴定银屑病及其中药疗效的生物标志物
In-depth serum proteomics reveals biomarkers of psoriasis severity and response to traditional Chinese medicine
影响因子：8.063
发表期刊：Theranostics
发表时间：2019.4
背景：
银屑病（Psoriasis；俗称牛皮癣）是一种免疫系统疾病，此病有病程长、难治疗、易复发等特点，其发病率占世界人口的0.1%～3%，目前全球约有银屑病患者超过1个亿，在我国约有一千多万名银屑病患者。此外，银屑病还能显著增加心脑血管等重大疾病的发病率，导致患者出现严重的心理压力、自卑、失落，甚至自杀倾向，极大程度地影响了患者的生存质量。血液中的蛋白可反映病人的生理病理状态，随着质谱技术的发展，有着更高定量准确性和重现性的DIA (Data Independent Acquisition)技术，可在血液中鉴定到数百种蛋白。本文采用这种技术，对银屑病患者的血液标志物及其对中药响应的标志物进行了探索。
样本及方法：
发现阶段：1）健康对照组：16例健康人血清；2）银屑病患者：23例银屑病患者血清；3）银屑病治疗组：11例经12周银屑病治疗的患者血清。采用抗体微阵列及DIA的方式进行检测。
验证阶段：1）健康对照组：20例健康人血清；2）疾病对照：10例荨麻疹患者血清；3）银屑病患者组：50例银屑病患者血清。采用ELISA的对候选biomarker进行验证。
结果：
1. 银屑病血清蛋白质marker
本部分通过QE-HF质谱仪对各组血液样本进行DIA检测，共鉴定到283个特异性肽段。对银屑病患者组和健康对照组进行比较发现58种差异蛋白，其中有已知的炎症和凝血相关蛋白。
图1 DIA检测银屑病患者血清蛋白
2. 临床指标、血清蛋白质组和银屑病严重程度的相关性分析
为了进一步说明血清蛋白质组的临床实用性，分析了临床指标、血清蛋白质组和银屑病指标间的相关性，发现了三个血清蛋白(PI3、CCL22、IL-12B)与银屑病指标正相关。
图2 血清蛋白质组、临床指标和银屑病指数的相关网络
3. 鉴定银屑病生物标志物
经统计分析，58个差异蛋白（P <0.01）可显著区分银屑病患者和健康对照，基于这些差异蛋白进行主成分分析，也同样可区分两组。在发现集和独立验证集中，用ELISA技术对PI3进行验证，结果均表明其在银屑病患者组中高表达。说明其找到的差异蛋白可能成为银屑病的潜在标志物。
图3 鉴定银屑病诊断蛋白
