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重磅发布 | 全新非靶向植物代谢组学产品,扫清这些发文障碍!

代谢组学在系统生物学中最接近表型,是时下研究热点。其中,非靶向代谢组学是一种没有偏向性的代谢组学研究方式,植物研究借助这种研究方式,可以全面系统地对样本中的代谢物进行定性、定量分析,从而对植物生长发育过程、生理状态和环境响应特性进行深入研究。


但是当前市面上的非靶向代谢组学产品对植物领域针对性不强缺乏针对植物的高质量标品数据库,存在鉴定效率低下、鉴定准确度不高、鉴定结果较少等问题,阻碍了植物代谢组学的研究和发展。


针对以上问题,华大推出全新非靶向植物代谢组学产品,使用液质联用(LC-MS)技术进行样本检测,通过超高分辨率的Q Exactive质谱平台获得高质量的数据,使用华大自建标准品数据库和在线标准品数据库 mzCloud 进行代谢物鉴定,鉴定准确度可获得显著提升,并采用精细的质控指标与严格的质控流程进行质控,打造专门针对植物的高质量代谢组学研究服务方案,为您的研究扫清不确定因素,更高准确度,发文更高效!



【实力鉴定】

作为此次新品的核心成果,研发团队基于Q Exactive平台,采用特定的色谱-质谱采集方法自主建立了华大高分辨植物代谢数据库(BGI High Resolution Accurate Mass Plant Metabolome Database,BGI HRAM-PMDB)。采用该数据库进行鉴定,鉴定结果可信度最高可达到 Level 1。


可信度 Level 1 究竟有多厉害?


可信度是代谢物鉴定的常见评价指标,划分为Level 1、Level 2、Level 3、Level 4和Level 5(如下图)。其中最高的 Level 1 可确定代谢物分子结构。



图 代谢物鉴定评估划分标准


要达到 Level 1 的鉴定可信度,需要使用保留时间(RT)、一级质谱(MS)和二级质谱(MS2)信息与标准品进行比对。然而标准品价格昂贵,且部分标准品获取困难,到目前为止还没有一个标准品数据库建立的标准流程,导致不同实验室、不同类型仪器、不同实验条件采集的保留时间和谱图有所差异,通用性不高。由此可见,拥有一个高质量的标准品数据库对植物代谢组学研究而言事半功倍,华大高分辨植物代谢数据库(BGI HRAM-PMDB)让您获得更高的鉴定可信度,为研究加分!



【华大高分辨植物代谢数据库(BGI HRAM-PMDB)



  • 全面涵盖各类植物代谢物

超过2500种植物代谢物标准品信息,涵盖氨基酸、维生素、有机酸、糖类、脂质、核苷酸、酚类、黄酮类、生物碱、萜类、醌类、甾体、木脂素、香豆素等各类初生和次生代谢物。数量和种类在高分辨植物代谢标准品数据库中属于领先水平。



  • 高分辨质谱平台

数据库依托高分辨率、高质量精度、高稳定性的UPLC- Q Exactive质谱平台建立,有力地保障了数据库谱图质量。



  • 信息全面、准确可靠

采用特定的色谱-质谱方法进行标准品数据采集。在正、负两个电离模式下,使用高、中、低三个碰撞能量采集数据。包含保留时间(RT)、一级质谱(MS)和二级质谱(MS2)信息,并且经过严格的人工核对、筛选和校正,数据库信息全面、准确可靠。



  • 可进行保留时间校正

不同时间段进行实验检测,即使使用相同的液相条件,代谢物的保留时间也会有所差异。为了充分、准确地使用保留时间信息进行鉴定,我们每个项目检测时,都会通过检测RT mix建立校正曲线,使用校正曲线对数据库中的保留时间进行校正。RT mix是我们为了进行保留时间校正而配制的标准品混合溶液,包含60种极性不同的代谢物标准品,其色谱峰可覆盖整个液相梯度,且分布均匀,能有效地进行保留时间校正。


  • 适用于药用植物代谢物鉴定

近年来,药用植物相关研究渐热,华大高分辨植物代谢数据库也涵盖了大量药用植物常见的化学成分,其中就包含在新冠疫情应对过程中被证实能有效抑制新冠病毒的黄芩苷。应用该数据库,可对中药材或药物中的黄芩苷进行准确鉴定。





图 黄芩苷二级质谱图匹配情况

(横轴上下分别为样本中黄芩苷和数据库中黄芩苷黄标准品的二级质谱图)


当前,该非靶向植物代谢组学新品已完成多个项目的测试,测试样本数超过1000个,包括水稻叶片、小麦根茎、茶叶叶片、柚子果皮果肉、药材等,并同时使用华大高分辨植物代谢数据库(BGI HRAM-PMDB)和mzCloud数据库进行代谢物鉴定。测试项目的代谢物鉴定数(Level 1 鉴定 + Level 2 鉴定)高达800-1500,鉴定结果的准确度和数量达到了行业领先水平。


从实验设计、样本收集和储存,到实验检测和数据分析,华大为您提供一站式的代谢组学服务!


心动不如行动,销售等您来撩!


送样要求:

样本量

新鲜植物组织      ≥1 g

冻干植物组织      ≥200 mg

干粉末                 ≥ 200 mg

生物学重复次数

每组 ≥6个样本


参考文献:

[1] Dixon, Richard A. "Phytochemistry meets genome analysis, and beyond." Phytochemistry 62 (2003): 815-816.

[2] Schymanski, Emma L., et al. "Identifying small molecules via high resolution mass spectrometry: communicating confidence." (2014): 2097-2098.

[3] Su, Haixia, et al. "Discovery of baicalin and baicalein as novel, natural product inhibitors of SARS-CoV-2 3CL protease in vitro." bioRxiv (2020).