1. 研究背景

2019年新冠病毒肺炎在全球肆虐，截止目前为止（2020年4月8日）已确诊的感染人数多达140多万。为了更多的了解病毒感染机制及易感性，本研究拟通过大样本数量的人群进行genome-wide association study (GWAS)研究，找到与病毒感染相关的易感基因及位点。

2. 技术策略

通过全基因组(WGS)或全外显子组(WES)测序结合genome-wide association study (GWAS)分析，找到与病毒感染相关的易感或抗性基因及位点。

3. 实验设计

注：如经费和样本量充足，建议样本量越多越好（≥1000例）

4. 测序策略

DNBSEQ平台文库和PE测序

WGS测序深度建议：≥30X（样本数量多，也可采用低深度测序）

WES测序深度建议：≥100X（样本数量多，也可采用低深度测序）

5. 案例展示

5.1 案例总结

5.2 案例解析

中文名：全基因组关联分析抗HBV病毒感染的基因

英文名：Genome-wide association study identifies 8p21.3 associated with persistent hepatitis B virus infection among Chinese

发表期刊：Nature Communications

发表时间：2016年

影响因子：12.124

研究背景：乙肝病毒（HBV）感染是一种常见的感染性疾病，导致世界范围内大量人群感染从而产生肝相关的疾病如肝癌等。为了了解感染，抵抗以及清除病毒的过程，通过genome-wide association study (GWAS)分析，找到抗感染相关的基因。

研究方法：1251例HBV感染者及1057例感染后自愈者，重复样本中4个独立人群中3950例感染者及3356例感染后自愈者，进行全基因组关联分析。

研究结果：通过GWAS分析了1,251个HBV感染者（PIs）及1,057个感染后自发恢复的人群(SRs)，同时做了4个独立人群中的3,905个PIs和3,356个SRs样本的重复样本。在8p21.3上发现了一个新的位点，进一步研究发现了在此位置上的一个关键基因INTS10。该基因通过IRF3抑制肝细胞中的HBV复制。在临床血浆样本中，与SRs相比，PIs中INST10水平显著降低，并且与HBV载量呈负相关。发现一个新的抗病毒基因INTS10在8p21.3清除乙肝病毒的感染。

参考文献

[1] LI Y F, Si L L, Zhai Y, et al. Genome-wide association study identifies 8p21.3 associated with persistent hepatitis B virus infection among Chinese[J]. Nature Communications ,2016, 7:11664. DOI: 10.1038/ncomms11664

[2] Hu Z B, Liu Y, Zhai X J, et al. New loci associated with chronic hepatitis B virus infection in Han Chinese[J]. Nature Genetics, 2013 doi:10.1038/ng.2809

[3] Li Y F, Zhai Y, Song Q F, et al. Genome-Wide Association Study Identifies a New Locus at 7q21.13 Associated with Hepatitis B Virus–Related Hepatocellular Carcinoma[J]. Clin Cancer Res 2018; 24 : 906-915.