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全基因组Bisulfite甲基化测序

产品简介

全基因组甲基化Bisulfite测序是DNA甲基化研究的黄金标准,它通过Bisulfite处理和全基因组DNA测序结合的方式,对整个基因组上的甲基化情况进行分析,具有单碱基的分辨率,可精确评估单个C碱基的甲基化水平,覆盖范围广。它可以构建精细甲基化图谱,建立表观遗传学研究数据库,为后续大规模开展不同样品间的甲基化差异分析提供参考图谱。

 技术流程

 

图片333

 

技术优势

技术稳定性、重复性好:从样本检测到文库构建、上机测序,每一步均有严格的标准操作SOP和对应的质控标准,保证每一个样本都得到真实的测序结果。

Bisulfite转化率高:经过不断优化建库方案,华大的甲基化建库BS平均转化率高达99%以上,作为文库构建的质控指标进行严格控制。

单碱基分辨率:精确分析每一个C碱基的甲基化状态。

准确性和可靠性高:准确区分甲基化的C和未甲基化的C。

检测范围广:覆盖全基因组范围内的所有位点。

无偏向性:反映真实的甲基化状态。

经验丰富:执行了上千个项目,数万个样本,合作发表文章100多篇。

信息分析

 

信息分析条款

信息分析内容

标准化信息分析

  1. 数据基本处理与质控;

  2. 比对结果统计;

  3. 甲基位点统计与分析:

  4. 甲基化位点鉴定;

  5. 甲基化位点类型统计;

  6. C位点甲基化水平分析(全基因组,染色体,功能元件);

  7. 甲基化位点序列特征Motif图;

  8. 甲基化水平IGV可视化文件(.bw);

  9. 全基因组甲基化水平分布(样本/分组);

  10. 基因基因上下游甲基化水平分布(样本/分组);

  11. 样本相关性和PCA分析;

  12. 差异甲基化分析:

  13. 差异甲基化位点(DMC)鉴定;

  14. DMC相关基因GO和 KEGG富集分析;

  15. DMC锚定Promoter区域相关基因GO和KEGG富集分析;

  16. 差异甲基化区域(DMR)鉴定;

  17. DMR相关基因GO和KEGG富集分析;

  18. DMR锚定Promoter区域相关基因GO和 KEGG富集分析。

定制化信息分析

可结合客户的需求,协商确定定制化信息分析内容

 

 

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