产品服务

产品简介

环状RNA（circRNA）是一类特殊的非编码RNA分子，与传统的线性RNA（linear RNA）不同，circRNA分子合呈封闭环状结构，且不受RNA外切酶影响，表达更稳定，不易降解。华大推出环状RNA高通量测序服务，可进行环状RNA的鉴定以及环状RNA与miRNA“海绵效应”分析， 可实现ceRNA（competing endogenous RNAs，内源竞争RNA）机制等研究。可应用在物种环状RNA表达谱构建，环状RNA疾病生物标记开发，环状RNA作用机制研究等方面。

技术优势

信息分析内容

一、标准信息分析

1. 数据处理：

   1. 对原始数据进行去除接头和低质量reads的处理

   2. 测序质量评估

   3. 过滤核糖体RNA

   4. 参考基因组比对

2. CircRNA预测及注释

3. CircRNA外显子及可变剪切

4. CircRNA来源基因鉴定

5. CircRNA表达定量

   1. CircRNA定量分析

   2. 样品相关性分析

   3. 样品间共有表达基因及特异表达基因维恩图

   4. 样品间CircRNA表达量聚类

6. 差异表达CircRNA检测

7. 差异表达CircRNA聚类分析

8. 差异表达CircRNA聚类分析

二、高级信息分析

1. 差异CircRNA来源基因GO功能分析

2. 差异CircRNA来源基因Pathway功能分析

3. miRNA靶向环状RNA预测