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LUSH数据分析加速系统
LUSH致力于为多种高通量测序平台的下机数据提供超高速、高灵活、可扩展、低成本的生物信息数据解决方案。
LUSH工具集基于经典流程中的软件模块BWA、SAMTOOLS和GATK,通过计算引擎和加速引擎的全新架构设计,实现算法优化和并行化处理,提供适配CPU和GPU两种硬件的高并行分析方案,最终获得准确的分析结果,最大程度减少数据分析的时间和成本。
LUSH产品已经过客户的广泛测试和验证,大幅提高临床综合分析能力,并推动临床测序应用。
LUSH优势
LUSH加速基因数据二级分析示意图
LUSH组件加速效果
LUSH产品亮点
- 高效
CPU版2小时内可完成30X WGS分析任务, GPU版30分钟完成30X WGS分析任务,分析效率得到大幅提升,极大降低计算成本
- 高准确性
基于GATK推荐标准流程的算法模型优化,分析结果与原版一致性超过99%,取消线程依赖,准确性较原版有所提高。
- 高稳定性
临床级稳定性,消除比对程序中的随机性,鲁棒性更强。
- 低成本
与用户现有的集群和云盘适配性强,在不增加硬件成本的基础上,提高产品交付效率
- 可迭代
自主研发产品,可随各客户产品升级而不断优化升级。
- 支持多种硬件方案
根据业务需求,提供CPU版和GPU版多种硬件方案, 并可根据需要进行扩展。
LUSH加速基因数据二级分析